Uma solução alternativa.
Abra um pdf e feche manualmente a barra lateral.
Em seguida, vá para Edit
- > Save current settings as Default
ou a combinação de teclas Ctrl + T .
Agora, toda vez que você abrir qualquer PDF, o sidepane ficará oculto por padrão.
Você pode vê-lo novamente indo até View
- > Side Pane
ou pressionando F9 .
Testado no Ubuntu 14.04, Evince 3.10.3