Problemas de lintianos podem ser explicados via lintian-info:
$ lintian-info -t source-is-missing
E: source-is-missing
N:
N: The source of the following file is missing. Lintian checked a few
N: possible paths to find the source, and do not find it.
N:
N: Please repack your package to include the source or add it to
N: "debian/missing-sources" directory.
N:
N: If this is a false-positive, please report a bug against Lintian.
N:
N: Severity: serious, Certainty: possible
N:
N: Check: cruft, Type: source
N:
Então, aqui, ele reclama que pode encontrar o que parece ser um objeto compilado, mas não o código-fonte correspondente.
No caso específico da libusb, distribuir o binário sem código-fonte seria uma violação de sua licença LGPLv2.1.
Neste caso, meu palpite é que você deve remover esta biblioteca libusb embutida do pacote e fazer com que o aplicativo use o que já está empacotado no Ubuntu.