Isto não deve ser um problema com o Ubuntu. Tenho certeza que é uma configuração na sua configuração da BIOS. Mantenha pressionada a tecla DEL ao ligar o computador para entrar na configuração do BIOS. Em algum lugar dentro deve haver uma opção para a placa gráfica interna (seja para ativá-lo ou desativá-lo). Você precisará configurar isto para ser ativado, então pressione F10 para salvar as mudanças e reiniciar. Se não houver tal opção, a decisão é tomada automaticamente e você não pode controlá-la. Muitas placas-mãe desativarão os gráficos internos quando uma placa PCI estiver conectada, sem que você tenha a opção de alterá-la.