Você pode substituir com segurança o carregador do Windows pelo GRUB. O GRUB pode gerenciar o Windows e o Ubuntu para você. Isso é simples, direto e livre de erros de inicialização dupla na minha experiência. GRUB rocks!
Eu mencionei simples, e estou falando sério. Tudo o que você precisa fazer é inserir sua mídia de instalação do Ubuntu, reiniciar, escolha Try Ubuntu without Installing
.
Agora, no modo ao vivo, execute esses comandos depois de se conectar à internet:
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && boot-repair
Basta escolher Recommended Repair
e seguir as instruções. O resultado final será que o GRUB será o seu Boot Manager, e com ele você poderá inicializar em ambas as janelas e quaisquer outras distribuições Linux que você possa instalar, incluindo o Ubuntu.
Boa sorte!
Fonte e referência: Reparo de inicialização: Ubuntu Docs