Os arquivos .ini são armazenados no diretório .wine ( ~/.wine ou /home/your_ID/.wine ) em um diretório chamado windows (há muitos em pastas diferentes).
Se você não encontrar seu .wine - > Esse é um diretório oculto, você pode acessá-lo através de seu navegador de arquivos, selecionando "Exibir - > Mostrar arquivos ocultos".
Espero que ajude.