Eu tenho medo que isso não possa ser feito, a menos que o desenvolvedor de um aplicativo tenha cuidado de um recurso como este. Mostrando uma barra de título no topo das janelas, não significa que o CDS está realmente desativado. Ainda falta o layout de janela clássico, ou seja, barra de título, barra de menu, barra de ferramentas, barra de status.
As Decorações do lado do cliente têm destruído a interface de usuário do Linux e tornaram os aplicativos e os ambientes de área de trabalho feios e não nativos.
Espero que todos os desenvolvedores ignorem as diretrizes do Gnome e mantenham seu aplicativo útil e consistente para todos os ambientes.