Você pode comentar a lista de servidores de pool em /etc/ntp.conf
e especificar seu próprio servidor. Deixe-me dar o passo inteiro:
Lado do servidor
Primeiro, desative o serviço ntpdate:
sudo update-rc.d -f ntpdate remove
Instale o NTP
sudo apt-get install ntp
Abra e edite o arquivo de configuração ntp:
/etc/ntp.conf
Comente esses servidores de pool e especifique seu próprio endereço de servidor, por exemplo:
server 192.168.20.1
Agora, reinicie o serviço ntp
sudo service ntp restart
Lado dos clientes
Instale o NTP
sudo apt-get install ntp
Em seguida, edite o arquivo de configuração /etc/ntp.conf
Por fim, especifique seu endereço de servidor:
server 192.168.20.1
Se você tem uma entrada DNS para o servidor NTP, você pode usar como:
server et.ntp.org
Reinicie
sudo service ntp restart
Você precisa ver isso para sua última pergunta:
Como verificar se o NTPD atualiza o tempo da máquina Linux com sucesso