Copiando o comentário do @Chris Morgan como uma resposta para tirar isso da lista não respondida. @ntherning já postou uma solução alternativa em sua pergunta.
Alguns relatórios de erros para você começar:
Freqüentemente executo o Windows 7 e o Mac OS X como sistema operacional guest no VMWare Workstation no Ubuntu 11.10. Sempre que pressiono a tecla Super (Windows) no Windows / Mac OS, o disparador Unity é ativado. Mesmo se eu estiver executando o VMWare em tela cheia. Isso é muito chato. Existe alguma maneira de dizer ao Compiz / Unity / etc para ignorar a tecla Super enquanto o VMWare está focado? Eu sei que eu poderia mudar o Unity para usar outra chave, mas eu gostaria de poder usar a tecla Super se possível quando não estou trabalhando no VMWare.