Minha solução para esse problema ocasional foi substituir Transmission with Deluge, que é mais funcional e parece ser mais sólido.
Isso está acontecendo comigo, no sentido de que a transmissão está congelando, tenho que forçar a saída e perco todos os dados baixados desde que foi lançado. É muito chato.
É algum tipo de problema de unidade, afeta outras janelas - a transmissão é apenas a mais irritante que acontece.
O tópico desse cara nunca foi respondido depois de um ano - espero não ter que esperar tanto tempo. Eu culpo compiz. Outras distros o lançaram e o Ubuntu precisa seguir em frente.
Minha solução para esse problema ocasional foi substituir Transmission with Deluge, que é mais funcional e parece ser mais sólido.