Isso aconteceu comigo depois de atualizar para 12.04.
Você deve instalar o indicador-appmenu que não foi instalado no meu sistema (ou foi removido pelo instalador). Depois disso, meu menu global estava funcionando perfeitamente. (Pode exigir um logout e in ou restart to connect.)
sudo apt-get install indicator-appmenu
Para aplicar imediatamente sem reiniciar o login Unity: Abra um terminal e edite:
unity --replace