O AHCI está ativado na sua BIOS? Se não tentar ligá-lo e tentar novamente.
Se isso ainda não funcionar, talvez seja necessário tentar algo um pouco mais complicado, pois hdparm
nem sempre funciona bem com as unidades SATA, que é o que presumo que você tenha.
Confira esta página para a seguinte solução relativamente simples que usa o crontab:
sudo apt-get install sg3-utils
crontab -e
Agora, adicione isso ao final do seu crontab (substitua sdx pela unidade que você deseja colocar em espera):
0-59/15 * * * * ( if [ ! -f /dev/shm/1 ] ; then touch /dev/shm/1 /dev/shm/2; fi ; mv /dev/shm/1 /dev/shm/2; cat /proc/diskstats > /dev/shm/1 ) >/dev/null 2>&1
0-59/15 * * * * ( export HD="sdx "; if [ "$(diff /dev/shm/1 /dev/shm/2 | grep $HD )" = "" ] ; then /usr/bin/sg_start --stop /dev/$HD; fi ) >/dev/null 2>&1
É claro que, antes de tentar algo assim, é altamente recomendável realizar um backup completo do conteúdo de seus discos rígidos.