Você estava perto - o Software Center apenas mantém um cache do histórico do APT em sua pasta pessoal. Se você precisar limpá-lo:
-
Exclua o log do histórico do APT,
/var/log/apt/history.log*
. (Não se esqueça dos arquivos de log girados .) -
Exclua o cache recuperado do Centro de Software,
~/.cache/software-center/apthistory.p
, da pasta pessoal de todos os usuários .
Não sei ao certo por que sua pergunta foi rejeitada.