Sim, funcionará sem problemas. Mas se você comparar o desempenho em ambos os sistemas operacionais, será melhor no Windows. Ainda assim, a maioria das pessoas não pode perceber isso.
Atualmente tenho 2 discos rígidos, 1 executando meu sistema operacional Windows e todos os meus aplicativos e outro para salvar todos os meus arquivos de mídia volumosos.
Se eu tivesse que limpar meu disco rígido que contém o Windows e instalar o Ubuntu nele, meu segundo disco rígido NTFS ainda funcionaria *?
* Por trabalho, quero dizer operar aparentemente como acontece no Windows; deixando-me ler e escrever arquivos de mídia com facilidade.
Sim, funcionará sem problemas. Mas se você comparar o desempenho em ambos os sistemas operacionais, será melhor no Windows. Ainda assim, a maioria das pessoas não pode perceber isso.