Na maioria dos casos, as incompatibilidades de hardware são raras e costumam estar com componentes de hardware específicos. É provável que o seu servidor funcione, mesmo que não esteja na lista de hardware certificado - a lista significa simplesmente que alguém testou para ter certeza de que tudo funciona , e provavelmente é fornecido com uma versão instalada e configurada do SO , com todos os drivers necessários.
É muito provável que não irá falhar. Já vi outros relatórios que funcionam bem. Não vi nenhuma menção de pânico do kernel ou instabilidade do sistema. O Ubuntu é instalado em uma grande variedade de hardware e geralmente funciona, então isso não deve ser um problema
Por outro lado, aparentemente, há às vezes um problema com o adaptador gráfico embutido e as configurações padrão - especialmente se você precisar de fglrx. O link recomenda a instalação do ssh durante a instalação inicial (algo que você deve fazer de qualquer maneira) caso isso aconteça. Caso o sistema inicialize sem saída de vídeo, pode ser necessário usar o ssh ou um console de recuperação para consertar os drivers.
Pode ser necessário fazer o backup de /etc/X11/xorg.conf , limpar e reinicializar e reinstalar fglrx e fglrx-amdcccle e, em seguida, reconstruir um novo arquivo xorg com sudo aticonfig --initial . Eu notaria que isso provavelmente não seria um problema com uma configuração de servidor que não usa nenhuma função relacionada ao X.