Isso faz sentido - Desative o proxy e update-upgrade
para obter as atualizações do repositório e, em seguida, ative o proxy para os PPAs - você pode criar scripts usando o $http_proxy
env var.
Editar: esse método ainda não é bom o suficiente. Este post sugere outra ideia. Talvez você possa configurar um proxy localmente, e esse proxy pode redirecionar para a universidade para todos os URLs, exceto para o seu servidor local.