Se o Ubuntu é o segundo instalado, geralmente toda a ajuda é ao instalar em um disco rígido, considerando que você o instalou em HDD separado, então eu não acho que isso importe.
Parte do problema pode ser que você está usando um disco rígido separado e os sistemas operacionais não estão atendendo. Então meu conselho será todo tentativa e erro, mas espero que você consiga resolver isso com a minha ajuda.
Agora, da maneira usual quando o Ubuntu é instalado em segundo lugar no topo do segundo, o grub substitui o registro do MBR, então você usa o grub e faz o seguinte
Para entrar no modo de configuração do GRUB, digite sudo grub
(na linha de comando e pressione Enter.) Em seguida, digite os seguintes comandos em sequência:
root (hd0,0)
setup (hd0)
quit
exit
O acima deve funcionar na linha de comando do arranque do grub - caso contrário, use o live CD e apenas execute a partir do CD e use o terminal.
No seu caso, você gostaria de fazer algumas alterações, já que esta configuração supõe que você esteja no mesmo disco rígido. Altere todos os "hd0" para "hd1".
Então será assim:
root (hd1,0)
setup (hd1)
quit
exit
O que você está fazendo é fazer o grub pegar a instalação do Windows 7 e configurá-la no grub.
Alternativamente, você precisará fazer um reverso com o Windows 7, mas alterar as informações do MBR dentro do Windows 7, adicionando uma linha adicional ao gerenciador de inicialização para fazê-lo inicializar o Ubuntu.
O bootloader do Windows 7 ficou mais complicado e você precisa usar bcdedit
para modificá-lo. Infelizmente, adicionando com ele pode revelar-se um grande aborrecimento a sua é uma forma alternativa que está usando um programa chamado EasyBCD que fará a alteração do carregador de inicialização do Windows 7 fácil.
Em teoria, deve funcionar, basta lembrar que está em um disco rígido separado, mas pelo que li, isso não deveria ser um problema.
Verifique Inicialize o Linux usando o gerenciador de inicialização do Windows 7 para mais informações sobre o bootloader do Windows 7.
Se você quiser fazer as duas coisas, depende inteiramente de você, mas dê uma chance a essas duas opções e veja o que acontece depois disso.
Espero que isso lhe dê alguma orientação sobre o que pode estar acontecendo de errado com sua situação atual, se isso não resolver o problema.