Você pode instalar o Ubuntu usando o Windows Installer (Wubi) em qualquer partição que o Windows possa ver que tenha um sistema de arquivos NTFS ou FAT32. Isso inclui aqueles em unidades externas. Contanto que o BIOS do computador possa ver e inicializar a partir da unidade externa, ele funcionará. Observe que as unidades externas que precisam ser desbloqueadas ou simular um CD não funcionarão.
O que acontece se você desconectar a unidade externa?
Nada. Você ainda será perguntado se deseja inicializar o Windows ou o Ubuntu. Se você inicializar o Windows, não há problema. Se você tentar inicializar o Ubuntu, ele se queixará de não encontrar wubildr.mbr (se você tiver o Windows Vista / 7/8) ou simplesmente não encontrar a instalação se você tiver o Windows XP e o enviar para um prompt grub. Se você cometeu esse erro, basta reiniciar.
Qual é o tamanho da instalação?
Para o Wubi, o tamanho escolhido é usado para criar um disco virtual fixo. Este é todo o espaço disponível para a instalação do Ubuntu. Sim, você pode acessar e salvar dados em outras partições montadas, mas, por exemplo, Se você tentar instalar o software ou qualquer coisa no sistema de arquivos do Ubuntu, logo ficará sem espaço com apenas 5GB. O máximo que você pode alocar com o Wubi é de 30GB, o que é uma quantia razoável para experimentar o Ubuntu se você planeja instalar vários aplicativos e armazenar alguns dados.
Se você ficar sem espaço na instalação do Wubi, é possível redimensioná-lo com um script para download, mas é melhor escolher um tamanho razoável antecipadamente.
Por que você precisa do Wubi com uma unidade externa?
Você não precisa do Wubi se tiver uma unidade externa. Você pode simplesmente instalar o Ubuntu diretamente na unidade externa, certificando-se de que o gerenciador de inicialização do Grub esteja instalado nele (não na sua unidade interna). Então, sempre que quiser, você pode conectar e inicializar a partir do External. E quando não estiver conectado, o Windows inicializará. Esse tipo de instalação é portátil para diferentes computadores (supondo que você não precise de drivers de hardware personalizados) e não depende do Windows de forma alguma.
Nota : Certifique-se de instalar o gerenciador de boot do Grub no externo, ou então você terá um prompt de resgate grub sempre que o externo não estiver conectado.