Sua melhor aposta aqui será fazer o backup de seus dados e reinstalar o Windows, se o CD de inicialização do Windows 7 não estiver detectando corretamente sua instalação para fazer uma instalação de reparo.
O Ubuntu poderá montar suas partições do Windows; você pode simplesmente montá-los e copiar dados deles para outro lugar. (Se você tiver muito espaço livre na unidade, uma sugestão seria copiar dados importantes do seu "C: drive" de 63GB para uma das outras partições, então quando você faz uma reinstalação limpa do seu disco do Windows 7, você pode apenas certifique-se de fazer uma "Instalação personalizada" e diga apenas para instalar essa partição de 63GB, não substitua nenhuma das outras.
Este tipo de problema é infelizmente muito comum em instalações do tipo boot duplo. Parece que quando você fez sua instalação do Ubuntu, você acidentalmente disse / permitiu que ela substituísse o MBR em seu disco rígido principal. No futuro, para ser ABSOLUTAMENTE COMPLETAMENTE 100% SEGURO, ao fazer uma instalação do SO e você NÃO deseja que o SO esteja instalado na unidade do sistema, considere a possibilidade de desconectar temporariamente a unidade do sistema completamente até que a instalação seja concluída. Não pode quebrar o que não está conectado!