Com o antigo e "morto" Gnome2, havia a possibilidade de adicionar notas a um arquivo ou pasta através da janela de propriedades. Havia uma guia dedicada para isso. Agora, com o Gnome3, essa funcionalidade desapareceu. Não sei se existe um complemento do Nautilus para isso, ou se no futuro o Gnome3 incluirá isso novamente.