Eu fiz um post sobre isso aqui Problema Nvidia GTS 450 HDMI
Mas basicamente você precisa usar o painel de controle de configurações da Nvidia e não o painel de controle padrão do Ubuntu.
Você também precisa executá-lo como root e salvar o arquivo de configuração x.
É bem simples de fazer e eu configuro desta forma no meu laptop com um conector RGB e ele inicializa e sai da suspensão perfeitamente para que haja esperança.
Não sei ao certo como o antigo Gnome trabalha com ele, pois uso o Unity, mas presumo que seja o mesmo.