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Quando o Win7 é instalado após o Vista, ele pus alguns arquivos de inicialização na partição do Vista. Quando você excluiu o Vista, você removeu também alguns arquivos de inicialização do Win7 (por exemplo, BCD). É por isso que o Win7 não consegue inicializar agora.
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Solução: corrija a inicialização do Windows por meio de um CD do Windows dessa maneira: link Em seguida, use Boot-Repair
Recommended repair
para recuperar o menu GRUB.