Estou usando o Ubuntu 11.11 e mono,
Sob referências / gtk-sharp, sou mostrado
"Assembly not available for Mono/.NET 2.0(in Mono 2.10.5)"
Como resolvo isso?
O Ubuntu tem política de incluir apenas uma versão de um pacote. No Ubuntu 11.11, a versão do mono incluída suporta .net 4. Portanto, qualquer programa que faça referência a assemblies .net 2.0 não funcionará. Você precisa alterar seu projeto para .net 4.0 e atualizar suas referências para usar a versão .net 4.0 dos conjuntos de que você precisa.
Como exemplo, a seguinte chamada solucionou o problema idêntico mencionado por você:
mono --runtime = v4.0 hello.exe
Caso contrário, a versão do tempo de execução é padronizada como v2.0.50727.