Certamente. Se você observar o pacote, a área de trabalho será construída sobre o mesmo núcleo do servidor. Qualquer um dos pacotes que você pode instalar no servidor pode ser instalado na área de trabalho.
Se você escolher, poderá instalar uma ou mais áreas de trabalho no topo do seu servidor. Veja os pacotes ubuntu-desktop, kubuntu-desktop, lubuntu-desktop, etc. Todos eles convertem uma instalação de servidor em uma instalação de desktop. Se você adicioná-los a uma instalação de desktop, poderá selecionar o ambiente de área de trabalho com o qual deseja trabalhar.
As ferramentas de um ambiente de desktop podem ser instaladas e executadas em outro ambiente de área de trabalho. O mecanismo de dependência garantirá que todos os pacotes requeridos pela ferramenta estejam instalados.