Da linha de comando
cd ~/Desktop
mkdir yes
fará um diretório chamado "yes" dentro do "Desktop" do usuário atual. Ele será exibido quase instantaneamente na sua área de trabalho.
Você também pode fazer
mkdir ~/Desktop/yes
No caso de idioma diferente do inglês, onde os diretórios são nomeados em outro idioma, esta é uma maneira mais genérica:
source $HOME/.config/user-dirs.dirs
cd $XDG_DESKTOP_DIR
mkdir yes
ou
source $HOME/.config/user-dirs.dirs
mdir $XDG_DESKTOP_DIR/yes