Se você instalou o GNOME (3.8) a partir dos repositórios padrão do Ubuntu 13.10, não há necessidade de desinstalar antes de atualizar.
Se você tiver instalado a versão mais recente do GNOME 3.10 pelo GNOME PPA, você deve removê-lo primeiro com o utilitário ppa-purge seguindo as instruções no artigo vinculado. Isso fará o downgrade dos pacotes do GNOME para as versões no repositório oficial do Ubuntu, para que a atualização da distribuição possa prosseguir sem problemas.