Sim, o Ubuntu é gratuito. Você não precisa pagar por dinheiro ou privacidade.
Possíveis preocupações:
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Costumava ser que a Canonical mantinha um acordo com a Amazon e permitia que pesquisas em um desktop padrão do Ubuntu fossem enviadas à Amazon após serem anonimizadas pelos servidores da Canonical. Ele estava ativado por padrão e podia ser facilmente desativado, mas, após a reação, agora está desabilitado por padrão (consulte Como posso remover os resultados da pesquisa da Amazon? do traço ou desativar o recurso? , Ubuntu com spyware? ).
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O acompanhamento pode ser feito pelo Concurso de Popularidade, que acompanha as estatísticas de instalação, mas também é opcional e anônimo. (Qual é o pacote 'popularity-contest'? )
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Há também o sistema de recomendação usado pelo Ubuntu Software Center, mas isso vai acabar em breve e não tenho tido muitas preocupações com a privacidade que eu conheço. ( Quais dados o Software Center usa para fornecer recomendações? )
Quanto à nuvem, o Ubuntu costumava ter um serviço em nuvem chamado Ubuntu One , e está há muito tempo morto. Agora, o Ubuntu One existe como um serviço de conexão única (SSO) para outros produtos da Canonical (Launchpad, Fóruns do Ubuntu, Ubuntu Wiki, etc.). Também foi opt-in enquanto existia.