Seu primeiro passo deve ser reclamar.
Estou chocado por ainda haver empresas empurrando coisas que exigem um navegador definido. É reflexo de um processo de desenvolvimento que saiu pela janela há mais de uma década. Esta é a sua escolha ativa. Esse é o porquê.
Normalmente, você pode contornar blocos simples com o User Agent Switcher . Eu usei isso para alguns bancos no passado. O Firefox apenas "fingirá" ser o IE e isso é suficiente para superar a maioria dos problemas.
Você pode descobrir que algumas coisas não funcionam. Eles podem ser codificados de forma tão única para o IE que o Firefox apenas se recusa a continuar ... Ou eles podem estar fazendo testes baseados em capacidade para trabalhar se você estiver usando o IE (que o User Agent Switcher não cobre). Se for esse o caso, sua única boa opção é virtualizar.
E com isso quero dizer instalar o VirtualBox ou o VMWare Workstation e instalar o Windows dentro dele. Você poderá então executar uma cópia real do Windows e uma cópia real do Internet Explorer em sua sessão do Ubuntu. Isso obviamente reduz uma parte do espaço em disco e leva tempo para inicializar, mas seu recurso está completo. Você não está se deparando com questões winegecko todos os outros pageload.