Sim, é um risco de segurança
Quando você está usando um usuário root, todos os aplicativos também são executados com privilégios de root. Não existem muitos vírus para o sistema operacional Linux (pelo menos em comparação com o Windows), mas cada vulnerabilidade nos aplicativos representa um risco maior do que com privilégios limitados. Na pior das hipóteses, essas vulnerabilidades podem resultar na destruição do seu sistema / coisas pessoais (apagar arquivos do sistema, seus arquivos de dados, etc). Bugs e vulnerabilidades podem aparecer em qualquer aplicativo, como o Firefox que você pode usar para navegar na Internet.
Além disso, é fácil causar danos ao seu computador como raiz. A pessoa não precisa ser novata no Linux, porque somos apenas humanos, um pouco de erros de comandos podem ter conseqüências severas. Já que o root não precisa digitar a senha, você é basicamente um comando longe da destruição ..
Eu recomendaria usar sudo command
em vez de alternar para o root ao executar tarefas administrativas ocasionalmente.
Aqui está outra postagem neste fórum relacionada a este assunto (veja o link abaixo)
Por que é ruim fazer o login como root?