Assumindo que você quer que o Ubuntu rode o boot com o grub
Entre no sistema como você tem feito, abra um terminal e execute estes dois comandos
sudo grub-install /dev/sda
sudo update-grub
Você pode tentar a ferramenta bootrepair
O wiki do Grub2 está aqui link mas como você disse, não é tão simples lidar com o legado do grub.