Você pode usar o programa anti-vírus de código aberto clamav para verificar seu computador
Para uma versão de linha de comando
sudo apt-get install clamav
Para analisar o seu PC, primeiro atualize a base de dados
sudo freshclam
Em seguida, execute uma verificação
sudo clamscam
Se preferir um gui install clamtk , é o mesmo anti-vírus, mas com gui
sudo apt-get install clamtk
Comoapontadopor@ThomasWnoscomentários,nãohánenhumamaneiragarantidadeencontrartodososbackdoorsabertos,ocursorecomendadodeaçãoatomar,sevocêsabequefoiinfectado,é"eliminar de órbita", significando exclua e reinstale o Ubuntu para ter certeza de que ele desapareceu.