(Como postado no link )
O autojump falha silenciosamente se o PROMPT_COMMAND tiver sido sobrescrito:
Se no seu .bashrc você tem export PROMPT_COMMAND="history -a; history -n;"
PROMPT_COMMAND - que o autojump requer - não será configurado corretamente.
Em vez disso: export PROMPT_COMMAND=$PROMPT_COMMAND"; history -a; history -n;"