Não há uma maneira (segura ou insegura) de executar arquivos .exe
em sistemas Linux ... "sem vírus" "ou não ...
.exe
arquivos são executáveis do Windows, para executá-los você tem que usar wine
ou uma VM do Windows.
Talvez você não tenha configurado a VM do Windows corretamente ... ela precisa de um pouco de tempo para aprender tudo.
Eu recomendo usar o KVM ou o VirtualBox para este propósito, ambas as soluções estão disponíveis no Ubuntu.
O VirtualBox é o aplicativo mais fácil de aprender e usar a virtualização e o qemu
(KVM) com virt-manager
, que fornece um desempenho melhor, é melhor para usuários mais avançados.