Não sei ao certo o que você está perguntando.
Oculto
Os arquivos ou diretórios são "ocultos" se começarem com um ".".
Na linha de comando você pode visualizá-los com ls -A
e do nautilus (seu navegador de arquivos) mostrando os arquivos ocultos Ctl + H ou do menu
Caminho
Seu caminho é onde o sistema procura para encontrar comandos.
echo $PATH
Você pode definir um caminho, normalmente em ~/.bashrc
PATH=$PATH:/additional/directory