O repositório do Skype é definido duas vezes. Uma vez em /etc/apt/sources.list.d/skype-stable.list
e novamente em /etc/apt/sources.list.d/skypeforlinux.list
. Você deve remover um deles ... mas qual deles? Faça isso ...
Em terminal
...
cat /etc/apt/sources.list.d/skype-stable.list
cat /etc/apt/sources.list.d/skypeforlinux.list
a saída dos comandos cat may pode ser diferente. O primeiro provavelmente será para a versão estável do Skype, e o segundo será para a versão beta do Skype. Revise-os com cuidado.
Você desejará ou ...
- delete the skype-stable.list file
- delete the skypeforlinux.list file
Para fazer um acima ... do ou ...
sudo rm -i /etc/apt/sources.list.d/skype-stable.list
sudo rm -i /etc/apt/sources.list.d/skypeforlinux.list
Atualizar
Parece que a Microsoft usou dois nomes diferentes de listas repo, dependendo de quando você instalou o Skype. O instalador mais recente, skypeforlinux-64.deb, na verdade, estabelece um arquivo /etc/apt/sources.list.d/skype-stable.list.
O arquivo /etc/apt/sources.list.d/skypeforlinux.list veio de uma instalação anterior do Skype ... então é aí que você termina com dois arquivos .list e causa todos os problemas.