Supondo que você esteja falando sobre o lançador de unidade, você precisará criar um arquivo .desktop para apontar para o pcmanfm.
A ajuda relevante do Ubuntu está aqui:
Essencialmente, acho mais fácil copiar um arquivo .desktop de trabalho de
/usr/share/applications/
para
~/.local/share/applications
e edite-o para apontar para o lugar certo.
O arquivo precisa estar no formato:
[Desktop Entry]
Version=x.y
Name=ProgramName
Comment=This is my comment
Exec=/home/alex/Documents/exec.sh
Icon=/home/alex/Pictures/icon.png
Terminal=false
Type=Application
Categories=Utility;Application;