A idéia é que, se o seu driver suportar 3D, você obterá o Unity, se o seu driver ou hardware não tiver uma área de trabalho padrão do GNOME 2.x.
A própria Unity será construída usando a tecnologia Compiz, que nos dá a capacidade de ter um modo de fallback para 2D, é por isso que podemos nos tornar altamente performantes, o que não poderíamos fazer com Mutter aceleração 3D necessária. Mais informações serão feitas no blueprint .
do RAOF resposta também tem mais informações.