Você deve instalá-lo totalmente no WINE no Ubuntu. Isso significa pegar seu DVD ou instalar arquivos e reinstalá-lo do zero enquanto estiver no Ubuntu.
Você não pode executá-lo a partir da sua partição do Windows. Ele requer acesso aos valores do registro e outros dados nas configurações locais para serem iniciados, que estão no registro do Windows.
WINE tem seu próprio registro e "disco rígido" com dados locais.