Com xrandr, use as opções --right-of
, --left-of
e --primary
conforme necessário.
Depois de encontrar as opções que você deseja, ligue para xrandr (com as opções que você deseja) ao fazer o login.
Do seu comentário:
xrandr --auto --output HDMI2 --primary --left-of VGA1
Veja o link e o man xrandr para detalhes.