Se esta for uma instalação do Windows 7 (ou Vista), é provável que os processos de pré-busca e super-busca tenham seu disco rígido em movimento. No entanto, esteja ciente de que isso pode indicar um problema no disco rígido (como um setor defeituoso) na partição do Windows.
Acabei de substituir um disco rígido ruim em um laptop Acer Aspire devido a inúmeros setores defeituosos. A partição do Windows falhou repetidamente (eu recarreguei o sistema operacional algumas vezes, embora ter uma instalação sólida fosse fútil). Minha partição Ubuntu correu bem, apesar de apresentar vários erros no disco rígido durante a inicialização.