Se você disse ao Ubuntu para formatar a unidade flash, e de fato formatar a (s) partição (ões), a unidade flash não poderá mais infectar um computador Windows.
Tecnicamente, sim, os arquivos infectados podem ainda existirem fisicamente na unidade, mas não há um descritor de arquivo apontando para esse arquivo, assim você nunca conseguirá ler o arquivo, a menos que você escolha aleatoriamente adivinhou a localização dele e usou uma ferramenta para copiar os dados brutos [como dd
].
Se você quiser limpar a unidade flash de todos os seus arquivos anteriores, basta preencher a unidade, com um arquivo em branco [na linha de comando dd if=/dev/zero of=/PATH/TO/flashdrive/bigfile
, em seguida, excluí-lo depois que ele enche todo o caminho. Se você estiver usando fat32, você terá que fazer vários arquivos, pois ele tem um pequeno tamanho máximo de arquivos] ou escolha um arquivo e continue copiando várias vezes.
tl; dr Não se preocupe, é seguro.