Não é fácil, o ubuntu provavelmente está instalado em uma partição ext3 (ou 4) e as janelas não podem ler o sistema de arquivos sem instalar alguns extras exóticos, o que eu ouvi não funciona muito bem.
Você pode fazer algo se instalou o Ubuntu via wubi, mas eu não acho que ele tenha a capacidade de atualizar ainda, apenas instale e desinstale.
A melhor solução pode ser inicializar no Ubuntu e atualizá-lo dessa forma, ou não atualizá-lo. Se você não tem intenção alguma de inicializar o Ubuntu, então por que você precisa atualizá-lo?