Você pode usar um script de shell baseado em xdotool para isso.
sudo apt-get install xdotool
Em seguida, escreva um script simples como este:
#!/bin/bash
WID='xdotool search --name "Mozilla Firefox" | head -1'
xdotool key --window $WID F5
Nomeie e coloque como quiser. Torne-o executável:
chmod a+x /path/to/script
Agora você pode simplesmente criar um atalho de teclado personalizado que executará o script e estará tudo pronto.