O suporte do LibreOffice para o formato ppt está longe de ser perfeito e muito pior do que o suporte para doc ou xls. Os problemas que você está enfrentando são esperados.
Você deve salvar seus slides como .odp, o formato nativo do OpenOffice e usar somente ppt quando quiser compartilhá-lo com outras pessoas. Dessa forma, eles vão manter o mesmo quando você salvar e abrir então.
Infelizmente, você ainda pode ter problemas ao exportar para ppt, se precisar de compatibilidade perfeita, precisará usar o PowerPoint ou convencer a outra parte a usar o Impress ou um programa mais compatível.
Uma ideia fora do tópico é pedir ao seu professor para usar o Google Docs. Pode ser mais fácil vendê-lo a um professor com foco em seus recursos de colaboração.