Desde que você instalou o Ubuntu usando o WUBI, o que significa que você fez dentro do Windows, será difícil (mas possível) ter apenas o Ubuntu. O que eu recomendo para o seu caso é apenas gravar a imagem ISO em um Pen Drive ou CDROM / DVDROM e instalá-lo através do instalador padrão do Ubuntu (Inicializando a partir da unidade de CD / DVD / USB). Dessa forma, você pode até optar por remover o Windows, se quiser, e tê-lo apenas com o Ubuntu.
Você também pode reparticionar o disco rígido para ter um espaço para o Ubuntu e um espaço para o Windows.
Basicamente, com o instalador do Ubuntu, você tem um pouco mais de liberdade comparado ao WUBI. E ainda por cima, é muito fácil de usar.