Irritantemente, eu tropecei na solução enquanto tentava consertar o problema. Eu corro gnome3 nesta máquina, e em e tentar resolver o problema com isso:
sudo apt-get install xserver-xorg-video-intel xorg-video-abi-20 xserver-xorg-core
e removeu ubuntu-gnome-desktop e muitos xorg drivers ... então, quando reiniciei, o teclado e o mouse não funcionavam. Eu inicializei em um live CD, montei e chroot na partição principal e removi xserver-xorg-video-intel e reinstalei ubuntu-gnome-desktop e todos os xorg drivers vieram junto com ele.
Quando eu reiniciei, de volta à partição principal, tive a funcionalidade de retorno para o teclado e mouse e o monitor externo funcionou também.