Obrigado, você acabou de confirmar o mesmo problema que eu estava tendo. Eu também tenho um Intel HD 3000 (Intel DZ68DB Motherboard). Com o RecordMyDesktop, não consegui que o vídeo funcionasse devido ao mesmo problema. Eu tentei o Ubuntu 13.04 (ainda em desenvolvimento) e funciona perfeitamente. Mas em 12.04 e 12.10 a única maneira que eu poderia gravar estava usando outra alternativa.
Para a Intel HD 3000 Series, eu recomendo o Kazam, uma vez que ele está funcionando sem problemas e grava muito bem, sem criar atraso no vídeo gravado ou o que estou gravando no momento. Se você gostou desta idéia, fique à vontade para adicionar o PPA:
sudo add-apt-repository ppa:kazam-team/unstable-series
e sudo apt-get update
e sudo apt-get install kazam
Eu escolho o ramo instável (que não é tão instável), pois é mais atualizado. Está funcionando muito bem no HD 3000.