Você pode ajustar a freqüência da CPU com o indicador-cpufreq disponível no centro de software. Ver abaixo. Eu nunca tentei o seu método.
eu corri
sudo update-rc.d ondemand disable
para desabilitar a escala de frequência da CPU sob demanda.
Pode ser reativado novamente em execução
sudo update-rc.d ondemand enable
os: ubuntu 14.04 lts.