Você deve atualizar para Kernel Linux 4.3 ou 4.4 que tem suporte para drivers de software livre Intel skylake e nvidia.
Depois disso, para a nvidia, você pode tentar as etapas abaixo.
Baseado neste link nvidia-361 é o driver da Nvidia GTX 960
Primeiro, desinstale os drivers NVIDIA instalados atualmente. Inicialize o computador, quando o menu GRUB aparecer ...
Destaque a entrada do menu do Ubuntu e pressione a tecla E. Adicione nouveau.modeset=0
ao final da linha do linux. Pressione F10 para inicializar o sistema operacional Ubuntu.
Quando a tela de login aparecer, pressione Ctrl + Alt + F1. Digite seu nome de usuário e a senha e execute:
sudo apt-get purge nvidia*
sudo reboot
Agora instale os drivers NVIDIA oficiais oficiais mais recentes. Inicialize o computador, quando o menu GRUB aparecer ...
Destaque a entrada do menu do Ubuntu e pressione a tecla E. Adicione nouveau.modeset=0
ao final da linha do linux. Pressione F10 para inicializar o sistema operacional Ubuntu.
Quando a tela de login aparecer, pressione Ctrl + Alt + F1. Digite seu nome de usuário e a senha e execute:
sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-361
sudo reboot
Nota: Talvez seja explicitamente necessário selecionar o adaptador NVIDIA no BIOS. Quando você deseja usar os drivers 361, não é necessário adicionar o PPA. Neste caso, os comandos do terminal que você deve executar são estes:
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-361
sudo reboot
Caso você tenha instalado o driver nvidia do seu site, então desinstale-o conforme as instruções. Desinstale esse driver executando, como root, sh ./NVIDIA-Linux-x86_64-361.28.run
e siga as instruções na tela
Observação: a solução que eu forneci foi testada no Ubuntu 14.04 LTS e no Ubuntu 15.10 para duas GPUs.