sudo apt-get install --only-upgrade thunderbird deve fazer o truque
Eu tenho alguns drivers personalizados da Nvidia + Cuda instalados. Fiz experiências ruins com a instalação de atualizações no Ubuntu. Várias vezes ele quebrou meu sistema desde que as novas atualizações estavam em conflito com o software instalado de maneira personalizada. Isso foi especialmente ruim quando o Ubuntu tentou instalar / atualizar sua própria versão dos drivers Nvidia enquanto destruía os meus manualmente instalados (Nvida + Cuda 6.5)
Desde que eu não quero ter essa experiência novamente: Existe algum comando do formulário
sudo apt-get install update for thunderbird only
Tal que apenas atualiza esse programa e não afeta todos os outros (assim como a atualização funciona no Windows).
Eu pesquisei por aí e sei que perguntas semelhantes foram colocadas, mas as respostas não funcionam ou novamente recomendam a instalação de todas atualizações de segurança, etc.
sudo apt-get install --only-upgrade thunderbird deve fazer o truque