Sim, é possível e suportado.
A maneira geral como as pessoas dividem sua instalação é colocar /
(a raiz) na partição menor e /home
(onde a maioria dos dados é armazenada) em uma partição maior. No entanto, você também pode colocar apenas /boot
no SSD e no restante do seu SO no HDD.
No entanto * 2, você pode instalar o Ubuntu completamente no HDD sem se preocupar com drives divididos e bootloaders duplos e tudo mais, e é isso que eu recomendo que você faça. Quando você instalar o Ubuntu, ele instalará o GRUB na partição EFI do disco rígido principal, que deve ser o SSD. O GRUB poderá inicializar o bootloader do Ubuntu e do Windows, mesmo se eles estiverem em unidades separadas. Tudo o que você precisa fazer é instalar o Ubuntu e configurar tudo para você.
Eu recomendo escolher a opção Something Else...
na configuração quando solicitado e dizer manualmente ao Ubuntu para instalar na partição que você deseja. Enquanto estiver nessa configuração, verifique também se a partição EFI será montada como /boot/efi
.
Se precisar de mais detalhes, comente e eu ajudo.